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抗白血病的NUDT15選擇性抑制劑的設(shè)計

發(fā)布日期:2020-10-19   來源:分子設(shè)計/鐘杰 & 張健   瀏覽次數(shù):0
核心提示:導(dǎo)讀:來自瑞典的研究人員開發(fā)了一種選擇性NUDT15抑制劑TH1760,并評價了其與巰嘌呤類藥物合用在AML中的潛在臨床用途。巰嘌呤類
 導(dǎo)讀:來自瑞典的研究人員開發(fā)了一種選擇性NUDT15抑制劑TH1760,并評價了其與巰嘌呤類藥物合用在AML中的潛在臨床用途。

巰嘌呤類藥物屬于嘌呤類抗代謝藥物,包括6-硫鳥嘌呤(6-TG)、6-巰基嘌呤(6-MP)和硫唑嘌呤(AZA)等,常用于白血?。ㄈ鏏LL和AML)和炎癥性疾病(如克羅恩病等)的治療。在細(xì)胞中,巰嘌呤類藥物轉(zhuǎn)化成活性代謝產(chǎn)物6-thio-(d)GTP,摻入到基因組原料中,引起無效DNA修復(fù),最終導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。NUDT15是NUDIX(Nucleosidediphosphate linked to moiety X, NUDIX)水解酶超家族成員,與NUDT1(MTH1)類似,但其對氧化型核苷酸的代謝較弱。

 

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NUDT15主要參與巰嘌呤類藥物活性代謝產(chǎn)物6-thio-(d)GTP的代謝清除。有關(guān)NUDT15的文獻(xiàn)主要集中在最近5年,目前對其生理功能仍知之甚少。臨床研究發(fā)現(xiàn)NUDT15基因多態(tài)性(如R139C)與巰嘌呤類藥物造血系統(tǒng)毒性升高顯著相關(guān)。在細(xì)胞及小鼠體內(nèi),敲除NUDT15可有效提高6-thio-(d)GTP的濃度。在NUDT15敲除小鼠中,巰嘌呤類藥物的給藥劑量可降低20倍而不影響抗白血病療效。這表明現(xiàn)有基于巰嘌呤的治療方法可通過靶向NUDT15的6-thio-(d)GTP酶活性進(jìn)行調(diào)控。因此,來自瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的研究人員開發(fā)了一種選擇性NUDT15抑制劑TH1760,并系統(tǒng)評價了其與巰嘌呤類藥物合用在AML中的潛在臨床用途。

 

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首先,研究人員利用酶聯(lián)孔雀石綠高通量篩選方法,對17946個化合物進(jìn)行篩選,根據(jù)抑制活性、潛在的結(jié)合效率及成藥性,選擇37個候選化合物進(jìn)行劑量效應(yīng)驗證,進(jìn)而得到化合物TH884(IC50=7 μM),作為NUDT15抑制劑開發(fā)的起點。研究人員對TH884進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系研究,通過對右側(cè)苯環(huán)進(jìn)行改造,最終得到先導(dǎo)化合物TH1760(IC50=25 nM)。在一系列與NUDT15序列或功能相似的蛋白中,TH1760對NUDT15具有非常好的選擇性。TH1760可劑量依賴性提高NUDT15的熱穩(wěn)定性,提示其直接結(jié)合在NUDT15上。

 

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為了進(jìn)一步闡明TH1760的作用機制,研究人員通過結(jié)構(gòu)生物學(xué)獲得了TH1760與NUDT15共晶結(jié)構(gòu)。從復(fù)合物結(jié)構(gòu)看,TH1760以6-thio-GMP相似的取向進(jìn)入NUDT15的底物口袋。與6-thio-GMP的鳥嘌呤類似,TH1760的苯并惡唑酮與Gly137骨架形成直接氫鍵。TH1760苯并惡唑酮的羰基與Leu138骨架以及磺胺基團與Thr94之間還形成了另外2個氫鍵。酰胺的O和吲哚的N分別與Arg34和Glu88之間形成水分子介導(dǎo)的相互作用。與6-thio-GMP相比,TH1760與NUDT15共晶中這些增加的相互作用賦予TH1760與NUDT15之間的高度親和力。

 

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然后,研究人員分別利用CETSA實驗和DARTS實驗證明TH1760可進(jìn)入細(xì)胞,與胞內(nèi)NUDT15結(jié)合。由于NUDT15活性喪失無明確的表型,但NUDT15控制巰嘌呤類藥物的藥效,因此,研究人員利用巰嘌呤類藥物抑制白血病細(xì)胞增殖作為表型,并以此研究抑制細(xì)胞內(nèi)NUDT15的作用。TH1760可通過抑制NUDT15,劑量依賴性增強AML細(xì)胞系NB4和HL-60對巰嘌呤類藥物的敏感性,并且在一系列血液細(xì)胞系中得到確認(rèn)。研究人員進(jìn)一步研究了TH1760在克服巰嘌呤類藥物耐藥性方面的作用,發(fā)現(xiàn)TH1760可增強6-TG耐藥性細(xì)胞系HCT116對6-TG的敏感性。在同源成纖維細(xì)胞BJ-hTERT(未轉(zhuǎn)化)和BJ-RAS細(xì)胞(表達(dá)SV40大T抗原和HRAS)中,TH1760對BJ-RAS細(xì)胞的6-TG增敏作用強于BJ-hTERT細(xì)胞,提示TH1760可能會增大巰嘌呤類藥物的治療窗。

 

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最后,研究人員利用同位素標(biāo)記的6-MP或未標(biāo)記的6-TG處理HL-60細(xì)胞,通過測定DNA的放射性或直接測定6-thio-(d)GTP的含量,表明TH1760對巰嘌呤類藥物的增敏作用是通過對NUDT15的抑制,導(dǎo)致巰嘌呤類活性代謝產(chǎn)物的增多所致,與DNA損傷及DNA損傷修復(fù)反應(yīng)等增加一致。

 

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作為First-in-class選擇性NUDT15抑制劑,TH1760有助于揭示NUDT15的生理功能。TH1760可通過抑制NUDT15,增強巰嘌呤類藥物的藥效,或者降低藥物劑量,克服耐藥性,其在AML上的臨床應(yīng)用值得進(jìn)一步研究。

 

參考文獻(xiàn)

1.    Zhang SM, Desroses M, Hagenkort A, et al. Development of a chemical probeagainst NUDT15. Nat Chem Biol. 2020;16(10):1120-1128.


 
 
 
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